Publikationen pro Jahr
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2024
Computational Identification of Crucial Factors for the Development, Treatment, and Progress of Immunological Disorders
Vetter, J., 22 Mai 2024, 180 S.Publikation: Typen von Abschlussarbeiten › Dissertation
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Effektivität von KI-Modellen in der Komplikationserkennung
Vetter, J., Strobl, M. T., Halmerbauer, G., Hochstrasser, T., Guttmann, J., Königswieser, T. & Winkler, S., 16 Mai 2024.Publikation: Konferenzbeitrag › Poster › Begutachtung
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IMPI: An Interface for Low-Frequency Point Mutation Identification Exemplified on Resistance Mutations in Chronic Myeloid Leukemia
Vetter, J., Burghofer, J., Malli, T., Lin, A. M., Webersinke, G., Wiederstein, M., Winkler, S. & Schaller, S., 13 Mai 2024, in: BioMedInformatics. 4, 2, S. 1289-1307 19 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access -
2023
Prediction of Patients' Length of Stay after Surgery using Multi-Model-Ensembles
Vetter, J., Strobl, M. T., Halmerbauer, G. & Winkler, S., 2023.Publikation: Konferenzbeitrag › Poster › Begutachtung
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The Class IIA Histone Deacetylase (HDAC) Inhibitor TMP269 Downregulates Ribosomal Proteins and Has Anti-Proliferative and Pro-Apoptotic Effects on AML Cells
Urwanisch, L., Unger, M. S., Sieberer, H., Dang, H.-H., Neuper, T., Regl, C., Vetter, J., Schaller, S., Winkler, S., Kerschbamer, E., Weichenberger, C., Krenn, P., Luciano, M., Pleyer, L., Greil, R., Huber, C., Aberger, F. & Horejs-Hoeck, J., 7 Feb. 2023, in: Cancers. 15, 4, 1039.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access4 Zitate (Scopus) -
Using Explainable Artificial Intelligence for Data Based Detection of Complications in Records of Patient Treatments
Strobl, M. T., Vetter, J., Halmerbauer, G., Königswieser, T. & Winkler, S., 10 Feb. 2023, Computer Aided Systems Theory – EUROCAST 2022 - 18th International Conference, Revised Selected Papers: 18th International Conference, Las Palmas de Gran Canaria, Spain, February 20–25, 2022, Revised Selected Papers. Moreno-Díaz, R., Pichler, F. & Quesada-Arencibia, A. (Hrsg.). Springer, S. 173-180 8 S. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); Band 13789 LNCS).Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/Tagungsband › Konferenzbeitrag › Begutachtung
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2022
ImmunoDataAnalyzer: a bioinformatics pipeline for processing barcoded and UMI tagged immunological NGS data
Vetter, J., Schaller, S., Heinzel, A., Aschauer, C., Reindl-Schwaighofer, R., Jelencsics, K., Hu, K., Oberbauer, R. & Winkler, S., 6 Jän. 2022, in: BMC Bioinformatics. 23, 1, S. 21 21.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access1 Zitat (Scopus) -
Prädiktion der postoperativen Verweildauer auf Basis von präoperativen Routinedaten in Krankenhäusern mittels Multi-Model-Ensembles
Vetter, J., Strobl, M. T., Halmerbauer, G., Hochstrasser, T., Guttmann, J., Königswieser, T. & Winkler, S., 17 Juni 2022.Publikation: Konferenzbeitrag › Poster › Begutachtung
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2021
Prospective Tracking of Donor-Reactive T-Cell Clones in the Circulation and Rejecting Human Kidney Allografts
Aschauer, C., Jelencsics, K., Hu, K., Heinzel, A., Gregorich, M. G., Vetter, J., Schaller, S., Winkler, S. M., Weinberger, J., Pimenov, L., Gualdoni, G. A., Eder, M., Kainz, A., Troescher, A. R., Regele, H., Reindl-Schwaighofer, R., Wekerle, T., Huppa, J. B., Sykes, M. & Oberbauer, R., 14 Okt. 2021, in: Frontiers in Immunology. 12, S. 750005 1 S., 750005.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access20 Zitate (Scopus) -
The NLRP3/eIF2 axis drives cell cycle progression in acute myeloid leukemia
Luciano, M., Blöchl, C., Vetter, J., Urwanisch, L., Neuper, T., Elmer, D. P., Bauer, R., Dang, H.-H., Strandt, H., Neureiter, D., Krenn, P., Tesanovic, S., Rieser, S., Bergsleitner, O., Zell, L., Binder, S., Schaller, S., Strunk, D., Pleyer, L. & Greil, R. &5 mehr, , 25 Juni 2021, in: bioRxiv.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel
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2020
A Bioinformatics Pipeline for the Identification of Crucial Factors for Transplant Rejection Based on NGS Data
Vetter, J., Heinzel, A., Aschauer, C., Reindl-Schwaighofer, R., Jelencsics, K., Hu, K., Oberbauer, R., Winkler, S. & Schaller, S., 2020.Publikation: Konferenzbeitrag › Poster
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Governance für Medizin-Benchmarking: Datenaufbereitung für KI braucht auch Governance
Arthofer, K., Strobl, M. T., Vetter, J. & Winkler, S., Aug. 2020, in: BI-SPEKTRUM. 2020, 3, S. 38-41Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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H. pylori modulates DC functions via T4SS/TNFα/p38-dependent SOCS3 expression
Sarajlic, M., Neuper, T., Vetter, J., Schaller, S., Klicznik, M. M., Gratz, I. K., Wessler, S., Posselt, G. & Horejs-Hoeck, J., 6 Okt. 2020, in: Cell Communication and Signaling. 18, 1, S. 160 160.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access17 Zitate (Scopus) -
Identification of immunologic factors associated with allograft rejection using NGS T cell receptor repertoire data
Vetter, J., Aschauer, C., Heinzel, A., Reindl-Schwaighofer, R., Jelencsics, K., Hu, K., Oberbauer, R., Winkler, S. & Schaller, S., 2020, in: Journal of Immunology.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Konferenzartikel
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Next Generation Sequencing Based Analysis of the T-Cell Receptor Repertoire Reveals an Increase of Alloreactive T-Cell Clones after Kidney Transplantation
Aschauer, C., Jelencsics, K., Hu, K., Reindl-Schwaighofer, R., Vetter, J., Heinzel, A., Kainz, A., Gualdoni, G., Schaller, S., Winkler, S. & Oberbauer, R., 2020.Publikation: Konferenzbeitrag › Poster
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White Box vs. Black Box Modeling: On the Performance of Deep Learning, Random Forests, and Symbolic Regression in Solving Regression Problems
Affenzeller, M., Burlacu, B., Dorfer, V., Dorl, S., Halmerbauer, G., Königswieser, T., Kommenda, M., Vetter, J. & Winkler, S., 2020, Computer Aided Systems Theory – EUROCAST 2019 - 17th International Conference, Revised Selected Papers. Moreno-Díaz, R., Quesada-Arencibia, A. & Pichler, F. (Hrsg.). Springer, S. 288-295 8 S. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); Band 12013 LNCS).Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/Tagungsband › Konferenzbeitrag › Begutachtung
4 Zitate (Scopus) -
2019
A Bioinformatics Pipeline for Identifying Point Mutations in CML Patients
Vetter, J., Burghofer, J., Malli, T., Webersinke, G., Kranewitter, W., Wiederstein, M., Schaller, S. & Winkler, S., 2019, Proceedings of the 27th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB).Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/Tagungsband › Konferenzbeitrag
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Chip-based Pillar Array Columns (µPAC™) for Proteomic Profiling of Signal Transduction in Acute Myeloid Leukemia
Rieser, S., Blöchl, C., Luciano, M., Vetter, J., Horejs-Hoeck, J. & Huber, C., 2019, Proceedings of the 17th Austrian Proteomics and Metabolomics Research Symposium 2019 (APMRS 2019).Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/Tagungsband › Konferenzbeitrag
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Effects of NLRP3 inhibition on cytokine release and cell proliferation in Acute Myeloid Leukemia (AML)
Luciano, M., Bergsleitner, O., Vetter, J., Zell, L., Dang, H.-H. & Horejs-Hoeck, J., 2019.Publikation: Konferenzbeitrag › Papier
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IL-1β Induces SOCS2 Expression in Human Dendritic Cells
Sarajlic, M., Neuper, T., Föhrenbach Quiroz, K. T., Michelini, S., Vetter, J., Schaller, S. & Horejs-Hoeck, J., 1 Dez. 2019, in: International Journal of Molecular Sciences. 20, 23, 5931.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access6 Zitate (Scopus) -
Next generation sequencing based assessment of the alloreactive T cell receptor repertoire in kidney transplant patients during rejection: A prospective cohort study
Aschauer, C., Jelencsics, K., Hu, K., Heinzel, A., Vetter, J., Fraunhofer, T., Schaller, S., Winkler, S., Pimenov, L., Gualdoni, G., Eder, M., Kainz, A., Regele, H., Reindl-Schwaighofer, R. & Oberbauer, R., 2 Sep. 2019, in: BMC Nephrology. 20, 1, S. 346 10 S., 346.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access15 Zitate (Scopus) -
T-Cell Repertoire of Tissue Infiltrating T-Cells at Time of Rejection
Reindl-Schwaighofer, R., Vetter, J., Weinberger, J., Schaller, S., Heinzel, A., Gualdoni, G., Aschauer, C., Jelencsics, K., Hu, K., Winkler, S. & Oberbauer, R., 2019, Proceedings of the American Transplant Congress.Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/Tagungsband › Konferenzbeitrag
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2018
(Retrospektive) Prädiktion von medizinischen Komplikationen auf Basis von Routinedaten in Krankenhäusern mittels Multi-Model-Ensembles
Vetter, J., Halmerbauer, G., Arthofer, K., Schaller, S., Ausch, C., Shamiyeh, A., Schauer, W., Königswieser, T. & Winkler, S., 2018, Proceedings of the 4th Kepler Science Day.Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/Tagungsband › Konferenzbeitrag
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High-throughput Immune Repertoire Sequencing Analysis using the Software ImmunExplorer
Vetter, J., Winkler, S., Fraunhofer, T. & Schaller, S., 2018, Proceedings of the German Conference on Bioinformatics. Computational Systems BiologyPublikation: Beitrag in Buch/Bericht/Tagungsband › Konferenzbeitrag
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Seasonal plasticity in photoprotection modulates UV‐induced hsp gene expression in copepods from a clear lake
Tartarotti, B., Alfreider, A., Egg, M., Saul, N., Schneider, T., Sommaruga, R. & Vetter, J., Juli 2018, in: Limnology and Oceanography. 63, 4, S. 1579-1592 14 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access7 Zitate (Scopus) -
White Box Modeling, Variable Impact Analysis, and Interaction Network Identification in Biological and Medical Data Using Symbolic Regression
Winkler, S., Schaller, S., Dorfer, V., Haghofer, A., Vetter, J. & Affenzeller, M., 2018, Proceedings of the German Conference on Bioinformatics. Computational Systems BiologyPublikation: Beitrag in Buch/Bericht/Tagungsband › Konferenzbeitrag